80,9% Lufthansa akciju pieder Vācijas akcionāriem. Otrajā vietā ar 4,3% ir ASV akcionāri, kam seko Beļģijas (3,9%), Lielbritānijas (3,1%), Šveices (2,6%) un Luksemburgas (2,0%). Pārējā daļa sadalās pa 139 valstīm. Lidsabiedrībai regulāri ir jāpublicē savas īpašumattiecības, jo pretējā gadījumā tā varētu zaudēt savas maršrutu tiesības. Maršrutu tiesības ar valstīm, kuras nav Eiropas Savienībā, pamatā ir piesaistītas nacionalitātei. Šī iemesla dēļ, lai apvienotos KLM ar Air France un, lai Lufthansa pārņemtu Swiss, ir paredzēti vairāku gadu pārejas periodi. Lidsabiedrības cer, ka pa šo laiku valdības atcels šos ierobežojumus.